O equilíbrio destas duas atividades no fígado e, portanto, o nível celular de frutose 2,6- bisfosfato, é regulado pelo glucagon. Esse hormônio é ativado quando a taxa de glicose no sangue é baixa, estimulando a enzima adenilato ciclase, que sintetiza AMP cíclico (cAMP) a partir do ATP. O cAMP é uma proteína que transfere um grupo fosfato do ATP para a proteína bifuncional (PFK-2/ FBPase-2) . A fosforilação dessa proteína aumenta a atividade da fosfatase (FBPase-2) e inibe a quinase (PFK-2). Portanto, o glucagon diminui o nível celular de frutose 2,6- bisfosfato, inibindo a glicólise e estimulando a gliconeogênese. A produção de glicose, que daí resulta, habilita o fígado a refazer, em resposta ao glucagon, os níveis normais de glicose sangüínea.